“一步到位”方案是指近期就将所有运输部门全部合并组建成运输部，并同时完成铁路政企分开；“分步到位”方案是尽快将已实施政企分开的公路、水运、民航和城市交通等部门先期整合为运输部，其他部门则限期整改后并入；中方案是所谓“戴帽方案”，即保留目前的各个部门，再成立一个由主管副总理兼任主任的交通委员会负责协调；慢方案则是维持现状，待条件完全成熟后再组建运输部。
此外，交通运输行政体制的改革，还必须实现纵方向上的权责贯通。交通问题涉及面广，与此相关的包括规划、审批、征地、投融资、建设、运营、补贴、市场与安全监管以及各类政策制定等等。在传统体制下，上述决策和实施过程被人为分割为多个阶段，由不同主体负责，政出多门、多家插手、甚至多家争利，但最后却都不愿或不能负责。
一个现象是，本应由交通运输部门承担的工作，由于该部门无力而为，只好由更高级别行政首长亲自挂帅，建立临时性办事机构去处理。究其原因，正是现有管理体制存在诸多权力钳制，靠正常程序无法高效率运转，只好借助外力打通血脉。
以交通规划为例，交通规划制度本是运输业合理发展的龙头，但目前最大问题是没有人能真正对规划负责，名义上地位很高，但权威性和可实施性实际相当差。从中央到地方省市，交通规划主管部门有时是交通部门，有时则是地方发改委或规划局，还有时甚至是省长或市长亲自挂帅制定，经常需要发改委出面协调。结果是有太多的部门想“负责规划”，却无法确定哪个部门及行政首长应“对规划负责”。
因此，在新体制中有必要把发改委的相关职能划归运输部，将综合运输部门作为交通规划的制定主体，营造从中央到地方都只有一个综合运输主管机构，并承担所有责任的行政体制。综合运输体制成功的标志之一，应是各级发改委在交通领域的“综合协调”职能得以解除，而与城市规划局等其他机构分别承担委托者、决策者、配合者或监督者之职。
作者为北京交通大学经济管理学院教授
