台湾“外交”丑闻案重创了民进党当局，“行政院副院长”邱义仁、“外交部长”黄志芳及“国防部副部长”柯承亨在一个小时内先后请辞并快速获准。不仅创下因弊案下台的当局官员层级的最高记录，也创下一天之内三位阁员因弊案一同下台的难堪纪录。

　　据台湾《联合报》7日报道，对本案始终保持沉默的陈水扁，昨天透过“总统府”新闻稿表示，他未主导及参与此案，但事情演变至此，伤害民进党形象，他深感愧疚，并向全民道歉。

　　五天前，邱义仁还声称不会矫情辞职，然而昨天下午，他在“行政院长”张俊雄同意下，举行记者会宣布请辞候查。谈到为何突然请辞，邱义仁表示，他前天已从“证人”变成“被告”，又遭限制出境，他认为自己应请辞。

　　在邱义仁记者会后半小时，黄志芳也举行记者会表示，丑闻案对台湾形象造成严重伤害，他身为“外长”“深感自责”，黄志芳眼眶含泪向民众鞠躬致歉。

　　他说，案发第一时间就应该主动辞职以负起政治责任，但他认为应该在最快时间内，向检方把案情交代清楚，所以等到昨天才辞职。

　　“国防部”则在昨天傍晚七点发出柯承亨请辞获准的声明，声明中指出，柯承亨虽多次表达未直接参与“台巴建交案”，但对检方搜索他位于“国防部”的办公室，造成“国防部”形象受损，深感自责。声明表示，柯承亨是7日下午3时提出书面辞呈。柯承亨本人从头到尾都未露面。